由新型冠状病毒SARS-CoV-2引起的新冠肺炎COVID-19，在全球规模内依然泛起发作之势。怎样更快、更准地举行病毒检测，推进治疗，仍是COVID-19的研究重点。在此配景下，丁香园旗下丁香通平台克日举行了第二期“新冠病毒检测专题钻研会”。壹定发生物CTO孙雷受邀作题为“单分子基因测序：相识病毒，战胜病毒”的专题讲座，重点先容了单分子基因测序手艺的原理特点，微生物检测应用chang景，以及在抗击新冠病毒中的事情。
直播回看：单分子基因测序：相识病毒，战胜病毒
1、相识病毒测序的意义
当前，新冠病毒检测要领多为核酸检测和抗体检测，通过发现新病原，剖析基因序列，多检早检早隔离，以此来到达控制疫qing的目的。但同时，壹定发更需要相识病毒的卵白结构和生物机理，便于疫苗和药物开发，而这些都是PCR或抗体检测做不到的。测序能够提供越发精准有用的病毒检测能力。
2、基因测序在病原检测上的应用
从2015年开shi，基于NGS的病原宏基因组流程逐渐成熟。mNGS在本ci新冠疫qing中检出了新型冠状病毒，新冠病毒和蝙蝠病毒最主要的演化区别又在S-基因和ORF-8区域。这一主要效果第一时间上报国家，和WHO共享，为新冠检测和新冠治疗指出偏向。
3、单分子测序手艺
COVID-19为线性单链RNA病毒，其基因特征的改变、病毒的撒播能力和病人临床体现随着疫qing生长泛起了许多新的转变。同时，检测限要求高，必须尽可能镌汰假阴性效果；检测样本重大，尤其是鼻咽拭子样本中病毒量颠簸大，且有人源和其它微生物核酸污染因素，从而加大了精准检测的难度。
单分子测序手艺具有快速、迅速的检测优势，无需基因扩zeng，缩短了制样时间和测序时间，能够精准检出潜在期的微量病毒拷贝，提高阳性检出率，能有用促进精准防疫。
现在国际上主要的几种单分子测序手艺包罗单分子荧光测序、单分子实时测序和纳米孔测序，均不需使用扩zeng。
4、基于GenoCare平台的病毒单分子测序方案
壹定发GenoCare单分子测序平台的优势在于速率和定量。主流NGS病毒制样流程需要多ci扩zeng，建设病原样品文库的时间长达6小时。GenoCare的制样流程相比之下会简朴得多。这里列出了两种方案。
第一种是宏基因组测序方案。它大幅缩减了扩zeng步骤，把制样法式从NGS的10步压缩到5步，速率快一倍，并可以同时检出其它种类病原。
第二种是特异性新冠测序方案，它使用特异性引物高效地对新冠病毒举行逆转录，对弱阳性的病毒样本检出率更高，也更适合于变异位点检测。
展望
本ci疫qing仍然存在尚未解决的疑难问题，如“无症状阳性”，病毒变异追踪，疫苗研发，病毒复现预防等，需要支付更多的测序事情去解答。
NGS和单分子测序的团结可以提供强盛的未知病原检测能力，病原测序将成为医院和疾控对不明熏染举行诊断的标配工具。国产测序平台的价值将日益凸显。
第三方磨练机构的测序能力将进一步提升，和医院、疾控部门的相助也会越发细密。病原测序的尺度化也将逐步实现，从测序仪，试剂盒，数据库，到陈诉都市越发规范化。
这chang人类与病毒的战争还远远没有竣事，基因测序事情者们会和一线医护战士一起相识病毒，战胜病毒！