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细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究
时间:
2022-09-19
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细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究

9月15日,壹定发生物与序祯达生物、UST配合签署协议,正式告竣战略相助。凭证协议,序祯达生物将接纳UST的TELL-Seq关联长读长二代测序手艺,并通过壹定发生物的GenoLab M高通量基因测序平台,推出经济可及的长读长测序解决方案,为宽大相助同伴提供高品质的检测剖析服务。作为此ci战略相助的第一个重量级效果,三方团结推出的「细菌基因组完成图-NGS跃级版」今日宣布

它的详qing,来一睹为快↓↓↓


细菌基因组完成图-NGS跃级版

组装细菌完整基因组是现代微生物研究的主要手段。使用细菌基因组完成图可以更好地研究主要基因功效、判断未知功效基因以及较量物种间的进化关系,这在熏染性疾病的研究、预防与治疗,情形微生物研究及疫苗和抗生物等的研究开发中都施展着主要作用。

序祯达生物接纳UST的TELL-Seq关联长读长二代测序手艺,团结壹定发生物的GenoLab M高通量基因测序平台,打造出一款通过二代测序平台即能靠近三代组装效果的全新产物——细菌基因组完成图-NGS跃级版。

丨长读长二代测序手艺让细菌基因组完成图绘制触手可及

细菌基因组完成图-NGS跃级版接纳了关联长读长二代测序手艺——TELL-Seq,gai手艺通过转座酶对来自统一条长DNA的小片断举行特定标志,使用标志对短读长序枚举行拼接,让二代测序的短读长数据发生超长读长测序效果,等价读长达20 kb-200 kb。经由创新开发的生信算法,组装的平均效果为contig(>10kb):1-10个;N50:2-5Mb(与基因组巨细关联)。

gai手艺不仅可用于微生物de novo测序(菌种判断),还可应用于基因组单倍体分型(Phasing)、基因组结构变异、新物种全基因组de novo组装等多个偏向。

细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究

丨细菌基因组完成图-NGS跃级版,展现细菌基因组完整面目

细菌基因组完成图-NGS跃级版通过基于TELL-Seq的二代测序手艺以壹定发生物的GenoLab M为载体,对细菌基因组举行测序,实现高性价比的基因组完成图组装,获得高准确度的基因组信息。

细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究

丨卓越效果,眼见为实

TELL-Seq手艺的测序数据可以组装出靠近完善的细菌基因组

细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究

样本要求及检测周期:

送样要求:≥50ng,片断长度>20kb,未经重复冻融,无降解,无污染

运输要求:-80℃生涯,干冰运输

检测周期:最短3周(收到样本至交付组装效果)

交付效果:DNA謘hi斐滤摺⒉庑蛳禄璼hi数据、组装效果


关于GenoLab M

GenoLab M是一款精准、高效、无邪、开放的桌面型高通量基因测序平台,其接纳基于芯片扩zeng的外貌荧光测序手艺SURFSeq对碱基的荧光信号举行识别,实现边合成边测序。GenoLab M可以兼容现在市面上主流的NGS文库制备产物和数据剖析流程。

相较于现在市chang上的同类竞品,GenoLab M在拥有双芯片平台的基础上,还支持'转动上机'模式,“转动上机”是指GenoLab M在运行单侧芯片平台测序时,用户可凭证现实实验需求随时启动空闲芯片平台的测试事情,“双芯片平台+转动上机模式”极大地提高了GenoLab M的检测无邪性,为用户带来了优异的使用体验。

细菌基因组完成图-NGS跃级版宣布,助力基因组学研究

参考文献:

1. Chen Z, Pham L, Wu TC, et al. Ultra-low input single tube linked-read library method enables short-read second-generation sequencing systems to generate highly accurate and economical long-range sequencing information routinely. Genome Res. 2020;30(6):898-909. doi: 10.1101/gr.260380.119.

2. Arun Sethuraman, Rosalina Stancheva, Ciara Sanders, et al. Genome of a novel Sediminibacterium discovered in association with two species of freshwater cyanobacteria from streams in Southern California, G3 Genes|Genomes|Genetics, Volume 12, Issue 7, July 2022, jkac123, https://doi.org/10.1093/g3journal/jkac123

3. Kumar, A., Im, K., Banjevic, M. et al. Whole-genome risk prediction of common diseases in human preimplantation embryos. Nat Med 28, 513–516 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-01735-0

4. Faith M Anderson, Noelle Visser, Kevin Amses, et al. Human commensal Candida albicans strains demonstrate substantial within-host diversity and retained pathogenic potential. bioRxiv 2022.09.09.507247; https://doi.org/10.1101/2022.09.09.507247

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