通过快速测序获得新发、突发熏染病病原体的高质量基因组序列对病原体致病机制研究、疾病溯源、疾病控制至关主要。FASTASeq 300支持自界说多个数据输出的节点且最快可在19.5小时内完成病原体基因组PE150测序，以更好地知足用户对检测时效性和研究信息周全性的双重需求。
为了评估FASTASeq 300在微生物de?novo组装应用上的体现，本ci测评选择了临床常见致病菌——嗜肺性军团菌1作为测试样本构建文库，文库划分在FASTASeq 300、GenoLab M和NV测序平台举行PE150测序，均取100×数据举行剖析。测评效果显示，FASTASeq 300测序数据质量高、序列组装效果与参考基因组具有较高一致性，其进化剖析与参考基因组能准确聚类于统一分支。
测序数据高
FASTASeq 300测序数据Raw data Q20大于97%，Q30大于92%，Clean reads/Raw reads比值平均大于0.99，测序质量体现优异。
图1. FASTASeq 300、NV和GenoLab M平台测序质量体现
组装质量好
与参考基因组序枚举行比对剖析，效果批注FASTASeq 300测序数据在组装质量方面与秠uan绕教ㄌ逑忠恢拢琇argest?Contig靠近基因组全长的1/3。
表1. 组装效果评价指标
组装完整性高
BUSCO2和Circos3图展示了FASTASeq 300测序数据组装效果的高完整性和准确性。
图2. ?BUSCO 组装效果和Circos 基因组完整性剖析效果图
进化剖析
基于FASTASeq 300测序数据组装的基因组序列及其22同种差异株的基因组序列构建系统进化树，效果显示FASTASeq 300测序数据组装的基因组序列效果与参考基因组能准确地聚类到进化树统一分支。
FASTASeq 300在微生物基因组de?novo组装应用偏向上性能优异，其快速、无邪、准确的特征可很好地知足病原体全基因组测序的要求。未来FASTASeq 300将助力更多微生物组学领域的科学研究和临床应用。
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1. 嗜肺性军团菌（Legionella pneumophila）：全基因组巨细约3.4 Mb，GC含量38.3%，是一种普遍存在于自然界中的时机致病菌，能引起以发烧和呼吸道症譪i鞯募膊
2. BUSCO组装评价：使用相近物种之间的一些守旧序列构建单拷贝基因集数据库，与组装效果举行比对，从组装效果比对上的比例、完整性，来评价组装效果的准确性和完整性。
3. Circos组装评价：接纳Circos软件对测序效果举行剖析，通过组装图谱的形式直观地体现出组装数据对参考基因组笼罩水平。