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壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序
时间:
2023-12-29
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全基因组甲基化测序文库(WGBS)的碱基比例严重失衡(GC%~20%),这给高质量的测序数据交付带来了极大的挑战。通常,壹定发接纳掺入高比例的专用平衡文库(例如PhiX文库、E.coli文库)或与GC含量40%~50%的其他应用样本Pooling测序的要领来缓解失衡,提高测序质量。然而,这种要领不仅降低了生产效率,还zeng加了测序的成本和操作的重大性。


壹定发生物高通量基因测序仪全系产物已实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序。本ci测试中,在0% PhiX平衡文库掺入的条件下,Q30均值≥92%、单index测序数据拆分率均值≥98%,与跟碱基平衡文库混淆测序的NovaSeq 6000平台数据体现相当。


【测试方案】

壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序


【测试效果】

(1)Q30均值达92%以上、单index 测序数据拆分率均值达98%以上

壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图1A. FASTASeq 300_0% PhiX重复测序体现


壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图1B. GenoLab M_0% PhiX重复测序体现


壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图1C. SURFSeq 5000_0% PhiX重复测序体现


(2)数据比秠uan硐钟乓欤80%以上

壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图2A. FASTASeq 300和GenoLab M平台重复测序的Mapping Rate


壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图2B. SURFSeq 5000重复测序的Mapping Rate



(3)甲基化类型和漫衍水平体现均高度一致

壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图3A. 差异甲基化类型的比例


壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序

图3B. 全基因组CG位点甲基化水平漫衍


壹定发生物通过手艺优化升级,全系产物实现了“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序。这一手艺突破,进一步zeng强了壹定发生物测序仪的产物力,为宽大用户提供更为高效、经济的测序平台工具。


【壹定发生物高通量测序仪产物先容】

壹定发生物:全平台实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序


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撰稿:崔青美

编辑:市chang部

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