克日，壹定发生物相助单元华中科技大学同济医学院基础医学院刘超红教授团队在Nature Communications（IF16.6,JCR Q1）上揭晓了题为“Expression of USP25 associates with fibrosis, inflammation and metabolism changes in IgG4-related disease”的研究效果。gai研究专注于泛素特异性卵白酶25 (USP25)的表达与IgG4相关性疾病(IgG4-related disease,IgG4-RD）之间的关联。基于GenoLab M高通量测序平台的转录组测序效果，研究团队剖析了IgG4-RD相关基因和通路的转录组水平转变，发现USP25可能与IgG4-RD的发病机制亲近相关。通过进一步的分子生物学实验，证实了USP25在IgG4-RD中表达显着下调，并通过加入多种信号通路，调治IgG4-RD特有的病理历程，包罗纤维化、炎症反映和代谢改变等。gai研究为明确IgG4-RD的重大发病机制提供了新的看法，并为疾病的诊断和治疗提供了潜在生物标志物和有用动物模子。

IgG4-RD是近年来新界说的一种由免疫介导的慢性炎症伴纤维化的疾病，可累及全shen多个组织和器官。IgG4-RD患者可能泛起线粒体功效障碍、B细胞代谢失调、炎症、纤维化、免疫失调等一系列临床体现。已有研究报道，特异性B细胞亚群的免疫失调是IgG4-RD发病机制的关jian，然而，导致B细胞功效失协调IgG4-RD疾病的详细分子机制尚不清晰。因此，作者通过RNA-seq，锁定USP25作为疾病相关的关jian基因，其在IgG4-RD中显著下调，可能是疾病生长的关jian因素。通过详细的分子生物学实验进一步探讨了USP25在疾病中的作用和可能的分子机制，为明确和治疗IgG4-RD提供了新的科学依据。

01?RNA-seq助力发现疾病关jian基因USP25

在IgG4-RD的研究中，通过流式细胞仪剖析，作者发现浆母细胞和影象B细胞的占比zeng加，而初shiB细胞和过渡性B细胞的占比镌汰，这种B细胞亚群的转变可能在疾病发病机制中饰演主要角色。B细胞bulk RNA-seq数据的KEGG富集剖析显示，IL-17信号通路在IgG4-RD中可能起到关jian作用，而USP25作为gai通路中的一个关jian调治因子，其转录本水平在IgG4-RD中降低，批注USP25可能加入了IL-17诱导的信号转导和炎症反映。PCR及Western Blot证实了USP25表达下调。单细胞RNA-seq剖析确定了 IgG4-RD的11个B细胞亚群，其中，在总影象B细胞和总初shiB细胞（包罗静息态初shiB细胞BN-R和激活态初shiB细胞BN-A）亚群中，USP25的表达都显着降低，与bulk RNA-seq中USP25的下调效果一致，提醒这两个B细胞亚群可能在疾病发病中占有主导职位。

图1 IgG4-RD中USP25 表达镌汰，B细胞活化缺陷

02?USP25潜在致病机制探讨

为了深入研究USP25在IgG4-RD的作用，作者构建了Usp25基因敲除小鼠，并验证了USP25下调会促进IL-1β介导的炎症反映和SMAD3诱导的纤维化。通过RNA测序剖析，作者发现USP25的镌汰导致RAC1的转录本下调，同时大量与RAC1相关的通路发生转变。进一步的分子生物学实验证实USP25的下调，会zeng加肌动卵白聚合促进了RAC1的泛素化和降解，从而抑制了ALDOA的激活及HIF1-α介导的糖酵解代谢。此外，在USP25缺陷的B细胞中，B细胞受体（BCR）信号小体的组成因素LYN的表达降低，从而降低了BCR信号，导致免疫缺陷。

图2 RAC1加入B细胞葡萄糖代谢的调治

1.?gai研究发现 IgG4-RD 中USP25表达下调，进而加入调治IgG4-RD相关的免疫缺陷、纤维化、炎症和异常代谢，并探讨了潜在的分子机制；

2.?gai研究提供IgG4-RD诊断潜在的生物分子标志物——USP25，并构建了合适的动物模子——Usp25基因敲除小鼠，为IgG4-RD的诊断和治疗提供资助；

3.?RNA-seq的深度数据剖析团结分子生物学实验验证，协助剖析了USP25相关的生物学意义。

Jiang P, Jing Y, Zhao S, et al. Expression of USP25 associates with fibrosis, inflammation and metabolism changes in IgG4-related disease[J]. Nature Communications, 2024, 15(1): 1-18.