高质量文库:单链建库手艺,先转化后加讨论,确保文库高度完整性和优异的测序质量。
高转化率:转化率>99%,并保持样本和批ci间的高度稳固。
甲基化高保真:基于专利酶转全基因组甲基化测序(酶转WGMS)手艺,到达cfDNA插入片断上的甲基化重新至尾高保真效果。
更多的甲基化位点:酶转WGMS比全基因组亚硫酸氢盐测序(盐转WGBS)检测到更多CpG位点并获得更高的有用笼罩深度。
低DNA起shi量:DNA起shi量可低至1ng,可获得稳固的文库和测序数据产出,以及稳固的转化率和掩护率。
FASTASeq?300测序仪已实现“甲基化0%平衡文库掺入”高质量测序,这意味着在不掺入专用平衡文库的条件下,FASTASeq 300依然能够提供高质量的测序数据。在0%PhiX平衡文库掺入的条件下,Q30均值≥92%、单index测序数据拆分率均值≥98%,与跟碱基平衡文库混淆测序的入口测序平台数据体现相当。
FASTASeq 300整体特点如下:
4种芯片规格,支持SE50-PE300/SE400多种读长
当莂n趁缸谆馐忠赵擞迷赾fDNA上时,会泛起越靠近插入片断3'端的平均甲基化率越下降的缺陷。竹石生物的酶转建库要领接纳优化后的专利建库流程和酶转反映系统,确保了cfDNA片断重新到尾都保持一致的甲基化率,实现了甲基化状态的高保真。
Reads列位置的甲基化率
竹石生物酶转WGMS相比传统盐转WGBS,在相同测序量下对基因组差异区域的笼罩深度越发匀称,并能笼罩到更多的CpG位点。在相同测序量下,酶转WGMS检测到的CpG位点数比盐转WGBS多10%~20%左右,尤其在CpG岛、启动子区等GC富含区优势显着。对全基因组以及甲基化检测的重点区域的有用笼罩深度,酶转WGMS也远超WGBS。
基因组差异GC含量区域的有用笼罩深度
具有差异笼罩深度的CpG位点数目漫衍
测序数据中的Duplication可能来自建库历程中的PCR扩zeng以及测序历程中的光学重复。在将测序Reads比对到参考基因组之后,这些Duplication reads会作为冗余数据被去除掉。gai甲基化整体解决方案显示,在相同文库相同测序量的qing况下,壹定发生物FASTASeq 300测序仪的Duplication rate显著低于A公司的竞品测序仪效果,可以获得更多的有用数据量。
Duplication rate秠uan
FASTASeq?300测序仪无邪的测序战略、用户友好及高度自动化的测序操作、快速的测序速率等特衴uan硐滞怀觯没Ы谠了项目周转时间,镌汰了操作失误,深得竹石生物用户的认可。竹石生物已基于壹定发生物测序平台面向高校、科研院所和企业开展了多物种种种样本类型的甲基化测序、扩zeng子测序等科技服务。信托竹石生物与壹定发生物的相助,将为甲基化研究带来新的视角和工具。